A SBEM foi fundada sob o nome de Sociedade de Endocrinologia e Metabologia do Rio de Janeiro em 1º de setembro de 1950, por iniciativa de José Schermann, Francisco Arduíno, Clementino Fraga Filho, Heitor Felix e Nelson Nogueira. O primeiro Estatuto foi esboçado em agosto de 1950, e foi mantido até 1954.