في الطرق المستخدمة لتحضير المواد البيولوجية (الحيوية) للاستعمال التجاري. هي هجين بين الهندسة الكيميائية والزراعية مع التركيز على استعمال التقنيات الحيوية. تركز هندسة العمليات الحيوية خصيصًا على العمليات المتضمنة في الكائنات الحية و الخلايا ، بعكس الهندسة الحيوية والتي تشمل كل شيء متعلق بالبيولوجيا (علم الأحياء).